Gut:可分析胃癌从紫杉醇治疗中获益的基因特征

2021-11-15 01:16:41 来源:
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由于癌(GC)的真核生物和分子小曲较为复杂,在此之前,还没有可视的预期性生物遥相呼应来指导GC病患者的用药并不需要。除了手术用药之外,予以辅助肌肉注射有望改善GC病患者的预后。除了5-氟尿嘧啶(5-FU)和硫类,化学疗法在部份GC病患者当中展现出了极佳的促活性,若可找到GC病患者化学疗法用药讨价还价的特别生物遥相呼应,则愈来愈进一步为GC病患者制定愈来愈必要的用药方案。

SAMIT是一项2×2因子随机III期临床试验中研究课题,将治愈性做手术的癌病患者被随机分为四一组,分别接受化学疗法+S-1(Pac-S-1)、Pac-UFT、却是S-1或UFT用药。

注解:UFT是尿嘧啶和替加氟的口服融合药;S-1是替加氟、吉米拉西(DPD药物)和奥曲西欣的口服融合药。

本研究课题的主要目的是识别系统预期癌病患者从化学疗法肌肉注射当中讨价还价的基因序列特征。对GC采样的476个基因序列进行药物测序。应用随机森林机器学习基本概念来开发新基因序列特征。一一组接受化学疗法和雷莫芦单促 (Pac-Ram)用药的独立国家癌病患者作为本体可验证配置文件。

Pac-UFT可验证配置文件当中Pac寻常和耐药性病患者的生存期

总体上,本研究课题对SAMIT试验中的499个采样进行了分析。在Pac-S-1训练配置文件当中,随机森林基本概念鉴定出了一个19-基因序列特征,将病患者分为了两一组:pac寻常一组和pac耐药性一组。在Pac-UFT可验证配置文件当中,pac寻常病患者的无病生存期(DFS)突出改善:3年DFS为66% vs 40% (HR 0.44, p=0.0029)。在却是UFT或S-1一组当中,Pac寻常和Pac耐药性一组病患者之间的预后无差异性。

Pac-Ram可验证配置文件当中Pac寻常和耐药性病患者的生存期

在本体Pac-Ram可验证配置文件当中,该基因序列特征预期的Pac寻常和Pac耐药性病患者的当中位无进展生存期分别是147天和112天(HR 0.48, p=0.022)。

综上,在大规模的癌试验中(SAMIT)当中,Sundar等使用机器学习技术,确切了一个可预期从化学疗法用药当中讨价还价的首个生物遥相呼应的基因序列特征。

原始出处:

Sundar Ragh,Barr Kumarakulasinghe Nesaretnam,Huak Chan Yiong et al. Machine-learning model derived gene signature predictive of paclitaxel survival benefit in gastric cancer: results from the randomised phase III SAMIT trial.[J] .Gut, 2021,

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